近日,迪安診斷與重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院感染病科、重慶醫(yī)科大學(xué)病毒性肝炎研究所、教育部感染性疾病分子生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室胡鵬教授團(tuán)隊(duì)在雜志《Infectious Disease of Poverty 》(IF=8.1,中科院一區(qū),TOP期刊)上以O(shè)riginal Article形式在線發(fā)表了關(guān)于中國(guó)大陸不同區(qū)域丙型肝炎病毒基因型的分子流行病學(xué)及系統(tǒng)發(fā)育分析的研究結(jié)果。
本研究是一項(xiàng)多中心的回顧性研究,共納入了來自中國(guó)大陸的29個(gè)省、直轄市及自治區(qū)的丙型肝炎病毒(HCV)感染患者共11008例。針對(duì)納入患者,本研究對(duì)HCV基因型在不同區(qū)域、不同省、市及自治區(qū)、不同人群中的分布進(jìn)行分析研究,并在分子流行病學(xué)層面上對(duì)HCV的基因型分布及系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化進(jìn)行了分析。
研究結(jié)果
HCV作為病毒性肝炎主要感染病毒之一,共有包括基因1型、2型、3型和6型4種基因型在內(nèi)的14個(gè)細(xì)分基因亞型。本研究表明,我國(guó)的HCV流行的型別中,基因1型比例最高,占比49.2%,其次是基因2型、3型和6型,分別占22.4%、16.4%和11.9%。按照基因亞型細(xì)分的話,排在前五位的基因亞型分別為1b、2a、3b、6a和3a。和既往報(bào)道的數(shù)據(jù)相比來看,基因1型和2型的比例有所下降,而基因3型和6型的比例則有所上升(P < 0.001)。
HCV基因亞型在全國(guó)的分布情況以及和之前的數(shù)據(jù)的比較。
本研究進(jìn)一步表明:按照年齡、性別分層劃分HCV分子流行病學(xué)來看,HCV基因3型和6型集中在30至50歲的患者中,且男性患者中1b和2a亞型的比例低于女性患者(P < 0.01)。而從區(qū)域分子流行病學(xué)來看,基因3型和6型在中國(guó)大陸的南部地區(qū)相對(duì)北部地區(qū)更為流行。
HCV基因亞型在中國(guó)不同區(qū)域及不同省/市/自治區(qū)的分布情況。
對(duì)基因型別測(cè)序結(jié)果進(jìn)一步分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)HCV基因1b和2a亞型的全國(guó)性傳播與中國(guó)大陸北部地區(qū)的序列相關(guān),而3a、3b和6a亞型的全國(guó)性傳播與中國(guó)大陸南部地區(qū)的序列有關(guān),這預(yù)示著HCV不同基因型別可能的起源和發(fā)展變遷。
通過NS5B部分序列構(gòu)建最大似然樹。圖a-e分別顯示了HCV 1b、2a、3a、3b和6a亞型的系統(tǒng)發(fā)生分析結(jié)果。不同顏色代表不同的地理區(qū)域。華南地區(qū):淺藍(lán)色,西南地區(qū):正紅色,西北地區(qū):紫色;華北地區(qū):深藍(lán)色,華東地區(qū):綠色,東北地區(qū):黃色,華中地區(qū):粉紅色。
總而言之,HCV基因亞型1b和2a仍然是中國(guó)大陸最常見的兩個(gè)基因亞型,涵蓋了我國(guó)70%左右的HCV感染,但其比例在過去幾年中有所下降,而基因3型和6型的比例有所上升。另外值得關(guān)注的是,基因型別的流行具有比較典型的南北區(qū)域差異。
消除丙肝工作是《“健康中國(guó)2030”規(guī)劃綱要》中的組成部分,本研究提供了中國(guó)大陸HCV病毒流行株的流行病學(xué)圖譜,有助于HCV感染的預(yù)防、診斷和治療,為中國(guó)消除丙肝工作提供參考。