論文發布截圖
該患者的血液樣本進行了全外顯子測序(Whole Exome Sequencing, WES),結果證實她患有CYP11B2/CYP11B1融合基因所致的11β-羥化酶缺乏癥。近日,這項由迪安診斷和寧波大學附屬第一醫院內分泌科合作的研究成果,發表于國際期刊《Frontiers in Endocrinology》(五年影響因子5.9/內分泌學與代謝Q2)。
疾病背景 先天性腎上腺皮質增生癥(congenital adrenal hyperplasia,CAH)是一組因腎上腺皮質激素合成途徑中酶缺陷引起的疾病,為罕見的常染色體隱性遺傳病。 其中,以21-羥化酶缺乏癥(21-OHD)最為常見,占90%-95%。其次為11β-羥化酶缺乏癥(11β-OHD),占5%-8%。11β-羥化酶由CYP11B1基因編碼,催化11-脫氧皮質醇和11-脫氧皮質酮(DOC)轉化為皮質醇和皮質酮。11β-羥化酶的缺乏導致11-脫氧皮質醇、DOC和睪酮水平升高,DOC和睪酮的蓄積導致高血壓和男性化。而皮質醇生成不足會刺激促腎上腺皮質激素(ACTH)的釋放,導致腎上腺皮質增生。
臨床表現
該患者是一名37歲的女性(核型為46,XX),童年時存在生長加速,且婚后一直未懷孕。2019年因疑診雙側腎上腺腫瘤入院(圖1A),前后進行了兩次腎上腺切除術。2022年,患者由于月經不規則被收入內分泌科,CT顯示右腎上腺皮質增生復發(圖1B),體格檢查顯示該患者皮膚色素沉著,面部有痤瘡和胡須,呈現男性化體征,生化檢查提示低鉀性高血壓,高雄血癥。均提示11β-OHD診斷。
圖1 患者腹部CT影像
檢測結果
該患者血液樣本送至迪安診斷實驗室進行腎上腺皮質增生檢測(包含全外顯子測序和CYP21A2檢測)。檢測結果顯示,CYP21A2基因未發現任何變異,但經全外顯子測序發現患者檢出一個位于CYP11B1基因1號外顯子的錯義突變CYP11B1:c.203T>G (p.Val68Gly)(圖2A、2B)。該變異未曾在數據庫和文獻中被報道,通過對該變異的保守性和三維蛋白結構的分析(圖2C、2D),考慮該變異可能為致病性。
圖2 CYP11B1:p.Val68Gly檢測結果及分析 同時,基于全外顯子測序的拷貝數變異分析(WES-CNV),檢出一個覆蓋CYP11B2基因7-9號外顯子和CYP11B1基因1-6號外顯子的拷貝數缺失(圖3A),隨后通過驗證證實了該拷貝數缺失的真實性(圖3C)。 由于CYP11B1和CYP11B2基因存在高度同源性,該缺失形成了一個由CYP11B2基因1-6號外顯子和CYP11B1基因7-9號外顯子組成的CYP11B2/CYP11B1融合基因(圖3B),該融合基因受到CYP11B2啟動子的調控,導致CYP11B1的異位表達和11β-羥化酶活性下降。 圖3 CYP11B1/CYP11B2融合基因
研究小結 CYP11B1/CYP11B2融合是導致11β-羥化酶缺乏癥的重要原因,但由于CYP11B1和CYP11B2的高度同源性,該融合基因通常難以檢測。本研究是目前首例對于使用全外顯子測序檢測出融合基因所致的11β-羥化酶缺乏癥患者的報道,還同時發現了CYP11B1:p.Val68Gly新型突變,擴大了CYP11B1基因的變異圖譜。 隨著二代測序(Next-generation Sequencing, NGS)的發展,全外顯子測序已成為大多數單基因遺傳病的一線診斷方法。全外顯子測序主要檢測的變異類型為單核苷酸變異(SNV)和小片段的插入缺失(InDel),而基于全外顯子測序的拷貝數變異分析,可以補充分析拷貝數變異(CNV),達到外顯子級別,在罕見遺傳病的臨床診斷中發揮了關鍵作用。
迪安診斷CAH相關基因檢測項目
迪安診斷臨床基因組中心嚴格按照ISO15189認可和美國CAP認證要求進行實驗室標準和規范的管理,具備樣本檢測、生信分析、報告解讀、遺傳咨詢、自主研發等綜合能力,積極參加并高水平通過NCCL、CAP、EMQN多項高通量測序室間質評。中心開發了基于全外顯子測序、家系全外顯子測序以及全基因組測序的遺傳病分析流程,能夠完成各類遺傳性疾病的篩查與診斷。